Заместитель Председателя Правительства Московской области - министр экологии и природопользования Московской области
Замеситители министра
Судебный отдел
Отдел правовой экспертизы
Отдел договорной работы
Заместитель заведующего отделом
Заведующий отделом - главный бухгалтер
Отдел делопроизводства
Отдел информационных технологий
Организационный отдел
Отдел государственной службы и мобилизационной работы
Отдел безопасности опасных объектов и территорий
Отдел экологической экспертизы и оценки негативного воздействия на окружающую среду
Отдел учета объектов негативного воздействия и нормирования влияния на окружающую среду
Заместитель начальника Управления
Северный отдел
Южный отдел
Западный отдел
Восточный отдел
Заместитель начальника Управления
Начальник управления
Начальник Управления
Отдел лицензирования полезных ископаемых
Отдел геологической информации
Отдел лицензирования подземных вод
Ведомства прямого подчинения министру
Территориальные отделы