Заместитель Председателя Правительства Московской области - министр экологии и природопользования Московской области
Замеситители министра
Судебный отдел
Отдел правовой экспертизы
Отдел договорной работы
Заместитель заведующего отделом
Заведующий отделом - главный бухгалтер
Отдел делопроизводства
Отдел информационных технологий
Организационный отдел
Отдел государственной службы и мобилизационной работы
Отдел безопасности опасных объектов и территорий
Отдел экологической экспертизы и оценки негативного воздействия на окружающую среду
Отдел учета объектов негативного воздействия и нормирования влияния на окружающую среду
Заместитель начальника Управления
Северный отдел
Южный отдел
Западный отдел
Восточный отдел
Заместитель начальника Управления
Начальник управления
Начальник Управления
Отдел лицензирования общераспространенных полезных ископаемых
Отдел геологической и гидрогеологической информации
Отдел лицензирования подземных вод
Ведомства прямого подчинения министру
Территориальные отделы